個別指導にも通わせながら、成績が上がらない原因はなにですか？

この度はご相談ありがとうございます。サピックスに通っていらっしゃるのですね。

個別での指導も受けており、授業は分からないわけではなく、内容自体も楽しいと言っているに成績につながっていかない・・・
親御さんとしては何がうまくいっていないのか悩むところですね。

お子さん本人が言っている
「授業は分からないわけではない（分かる）」
「授業も楽しい」
という言葉自体が事実だとすると、他の何かがうまくいっていないためテストでの点数につながっていないということになります。

授業で先生の言っていることは「分かる」が、テストになると点につながらない場合、原因として考えられるのが、内容は「分かる」が「できる」ようになっていないことです。

問題の解説を聞いて、言っている意味が理解できるのが「分かる」で、その内容を自分自身で咀嚼して、自分の言葉で頭に収納し、問題を解く際に自在に引き出して使うことができる状態になっているのが「できる」状態です。

ご質問には具体的にどの科目で成績が伸び悩むか書かれていませんので、たとえば算数であれば、

という順番で、一連の流れができるようになって初めて正解にたどり着くことができます。塾で習って「分かる」ということが、解法知識を知るという内容にとどまっているとすれば、他の部分の確認が必要になります。
普段の問題演習の様子や、授業の理解度の確認、テストの結果分析など、学習全体を見渡してみる必要があります。

個別の先生にも一度そのあたりの確認をしてもらうと、点数が伸び悩む原因が見えてくるかもしれません。
SS-1でも学習カウンセリングで学習全体のサイクル確認や、ご家庭での学習に対する有効な関わり方も含めてアドバイスをさせていただく機会を設けていますので、ご希望の際にはご連絡ください。